Hallo Alex,
doch das geht.
Du hast ja bereits zwei unterschiedliche E.-Mail-Konten eingerichtet.
Als nächstes öffnest du unter "CMS -> Nachrichtenvorlage" z.B. die Nachrichtenvorlage "OrderPlaced.CustomerNotification".
Unter dem Reiter "Info" weist du das E-Mail-Konto A zu.
Danach auf den Reiter "Shops" klicken und die Nachrichtenvorlage für den Shop A begrenzen.
Dann die Nachrichtenvorlage speichern.
Als nächstes öffnest du die gleiche Nachrichtenvorlage erneut.
Jetzt wählst du als E-Mail-Konto "B" aus und beschränkst die Nachrichtenvorlage auf Shop B.
Jetzt nicht auf "Speichern" klicken sondern auf "Vorlage kopieren" klicken.
Liebe Grüße
Wolfgang